复旦大数据学院 王戈飞 助理教授
报告生成时间：2026年9月15日
个人主页：王戈飞（Gefei Wang）
所属团队：复旦大学大数据学院（School of Data Science, Fudan University）自建课题组，研究方向为 AI 驱动的单细胞与空间组学计算方法（生成式建模与基础模型）；截至报告日公开资料未显示其隶属于学院内某一既有实验室
一、学者基本信息
| 字段 | 内容 |
|---|---|
| 姓名 | 王戈飞（Gefei Wang） |
| 职称 | 助理教授（Assistant Professor），复旦大学大数据学院（据学院官网师资名录与个人主页一致确认） |
| 所属单位 | 复旦大学大数据学院（2026 年入职） |
| 研究方向 | 深度生成学习、机器学习、科学智能（AI for Science）；具体聚焦于单细胞与空间组学的生成式建模与基础模型、计算生物学与生物医学数据科学 |
| 博士学位 | 香港科技大学数学系，数学博士（2019–2023），导师为杨灿（Can Yang）教授与杨王（Yang Wang）教授（联合指导，据其个人主页） |
| 博士后 | 耶鲁大学生物统计系（Department of Biostatistics, Yale University）博士后副研究员（Postdoctoral Associate，2023–2026），合作导师为赵宏宇（Hongyu Zhao）教授 |
| 本科 | 北京师范大学数学科学学院，数学与应用数学专业理学学士（2015–2019，据其个人主页 CV） |
| 学术标识 | ORCID: 0000-0001-5627-9918；Google Scholar: xBuiA5AAAAAJ |
| 邮箱 | wanggefei@fudan.edu.cn（办公地址：上海市国权路 579 号 C 楼 417 室） |
| 国家级人才 | 公开资料未披露其入选国家级人才计划的记录；其博士期间曾获香港博士研究生奖学金计划（Hong Kong PhD Fellowship, HKPFS）资助 |
同名消歧说明：本报告以复旦大学大数据学院官网（sds.fudan.edu.cn）师资名录中的"王戈飞（助理教授）"为准。OpenAlex 数据库中存在多条 "Gefei Wang" 作者记录，其中记录 A5103194170 疑为多人合并档案（同时包含南京医科大学/南京大学纳米医学方向论文与香港科技大学机器学习方向论文），本报告依据其个人主页（gefeiwang.github.io）与 ORCID（0000-0001-5627-9918）精确消歧，仅采信其本人主页列出的发表记录。其他同名者（如中国电子科技集团、西北核技术研究院等机构的 Gefei Wang）与本报告对象无关。
二、教育背景与职业履历
王戈飞是一位典型的"数学训练出身、转向 AI for Science"的青年学者。2015 年至 2019 年，他在北京师范大学数学科学学院攻读数学与应用数学专业，获理学学士学位。本科毕业后，他于 2019 年赴香港科技大学数学系直接攻读博士学位，获香港研究资助局/大学教育资助委员会设立的香港博士研究生奖学金计划（HKPFS）资助——该计划面向全球选拔，是香港地区竞争最激烈的博士奖学金之一。
博士期间（2019–2023），他在杨灿（Can Yang）教授与杨王（Yang Wang）教授联合指导下开展研究，学术路径呈现清晰的两阶段特征：早期聚焦深度生成学习的理论与方法，其代表作"Deep Generative Learning via Schrödinger Bridge"（基于薛定谔桥的深度生成学习）发表于 ICML 2021，是薛定谔桥（Schrödinger Bridge）这一随机最优传输框架在深度生成模型中较早的系统性应用之一，与随后兴起的扩散模型（diffusion model）技术路线一脉相承；中后期则将生成式建模方法系统性地引入单细胞与空间转录组数据分析，先后产出 Portal（Nature Computational Science 2022，大规模图谱级单细胞数据整合的对抗域转换网络）与 STitch3D（Nature Machine Intelligence 2023，联合建模多切片构建全生物体三维空间图谱）两项代表性工作。2023 年 5 月，他获香港科技大学理学院"HKPFS Extra Funding Award for Outstanding Academic and Research Performance"。
2023 年博士毕业后，王戈飞赴美国耶鲁大学生物统计系从事博士后研究（2023–2026），合作导师为赵宏宇（Hongyu Zhao）教授。耶鲁期间他将研究重心进一步推向生物医学数据科学前沿：作为第一作者发表 scMODAL（Nature Communications 2025，单细胞多组学数据对齐的通用深度学习框架）与 scLAMBDA（bioRxiv 2024，单细胞多基因扰动响应建模与预测），并作为合作者参与空间转录组整合方法（Nature Genetics 2026）、跨物种基因功能解读多模态基础模型（NeurIPS 2025 FM4LS Workshop）、小鼠狐猴（mouse lemur）全生物体分子细胞图谱（Nature 2025，Tabula Microcebus 联盟）等工作。
2026 年，王戈飞回国入职复旦大学大数据学院，任助理教授，组建独立课题组。据其个人主页，课题组致力于开发机器学习、人工智能与统计方法，应用于计算生物学与生物医学数据科学，重点关注面向单细胞与空间组学的生成式建模与基础模型，目前正在招收学生。
职业履历要点（时间线，据其个人主页 CV）：
| 时间 | 事件 |
|---|---|
| 2015–2019 | 北京师范大学数学科学学院，数学与应用数学专业，理学学士 |
| 2019–2023 | 香港科技大学数学系，数学博士（导师：杨灿、杨王；HKPFS 资助） |
| 2019.11 | 获 HKUST Excellent Research Award |
| 2021 | 一作论文"Deep Generative Learning via Schrödinger Bridge"发表于 ICML 2021 |
| 2022 | 共同一作论文 Portal 发表于 Nature Computational Science；获港科大数学系 Din-Yu Hsieh 教学奖、Epsilon Fund Award、RedBird 学术卓越奖 |
| 2023 | 一作论文 STitch3D 发表于 Nature Machine Intelligence；获港科大 RedBird 学术卓越奖、理学院 HKPFS 额外资助奖；博士毕业 |
| 2023–2026 | 耶鲁大学生物统计系博士后副研究员（合作导师：赵宏宇） |
| 2025 | 一作论文 scMODAL 发表于 Nature Communications；获 STATGEN 2025 Travel Award |
| 2026 至今 | 复旦大学大数据学院助理教授，组建课题组 |
需要说明的是，王戈飞的博士联合导师之一杨王（Yang Wang）教授为香港科技大学数学系资深教授，其个人主页链接指向香港大学校长办公室领导层页面，显示其现已任职于香港大学（具体职务以其校方页面为准）。这一"北师大数学本科—港科大数学博士—耶鲁生统博士后—复旦大数据学院教职"的履历，是典型的国际化统计/机器学习青年学者成长路径。
三、学生培养情况
王戈飞 2026 年方入职复旦大学大数据学院，截至报告生成日（2026 年 9 月），其课题组尚处于组建初期，公开资料中未见其名下有在读或毕业学生的记录。其个人主页明确表示"We are actively looking for motivated people to join our group"（正在积极招收课题组成员），说明招生工作刚刚启动。
在入职复旦之前，其在香港科技大学博士期间曾长期承担助教工作，教学训练扎实：先后担任统计推断（MATH 3423）、概率论（MATH 2421）、应用统计（MATH 2411）、实分析（MATH 3033）、统计机器学习（MFIT 5010）、机器学习及其应用（MAFS 6010S）、微积分（MATH 1013/1014）等课程助教，并于 2022 年 5 月获港科大数学系 Din-Yu Hsieh 教学奖（Din-Yu Hsieh Teaching Award）——该奖项专门表彰数学系教学表现突出的研究生助教，可视为其学生指导潜力的早期佐证。此外，据其 CV，他 2017 年 8 月曾在四川万源中学担任支教志愿者。
其在博士与博士后期间以共同作者身份参与多项国际合作，按学术惯例对其中低年级学生（如耶鲁课题组的合作者）有过实际指导贡献，但此类"非正式指导"公开资料未披露具体名单，本报告不作推断。
四、学术合作网络
4.1 学院内部（复旦大学大数据学院）
王戈飞入职时间较短，公开资料未披露其与学院内教师的具体合作项目。从方向契合度看，学院内部与其研究存在潜在交集的同事包括（据学院师资名录整理，仅为方向邻接，不代表已存在合作）：
- 周宝健（青年副研究员）：研究方向含扩散语言模型、科学智能，与王戈飞的生成式建模 + AI for Science 路线直接相邻；
- 孙鑫伟（副教授）：高维统计、因果推断与机器学习，及其在医疗影像中的应用，与王戈飞的统计学习方法与生物医学应用方向相邻；
- 罗珞（青年副研究员）：机器学习与优化理论，且与王戈飞同为港科大数学系背景（罗珞曾于港科大数学系任博士后）；
- 冯建峰（教授、院长）：计算神经科学与人工智能，其领衔的类脑智能科学与技术研究院体系与生物医学数据科学存在交叉。
其课题组目前为独立建制，公开资料未显示其挂靠在学院内某一既有重点实验室。
4.2 国内合作（含香港）
- 香港科技大学杨灿（Can Yang）教授团队（博士导师，核心合作者）：杨灿为港科大数学系教授（截至 2025 年公开讲座信息仍在任），浙江大学学士/硕士、港科大电子与计算机工程博士，曾任耶鲁大学博士后与副研究员——王戈飞的"港科大博士—耶鲁博后"路径与其导师完全一致，师承脉络清晰。双方合作成果包括 ICML 2021（薛定谔桥生成学习）、Nature Computational Science 2022（Portal）、Nature Machine Intelligence 2023（STitch3D）三篇标志性论文，杨灿均为通讯作者。王戈飞博士期间的主要软件（DGLSB、Portal、STitch3D）均托管于杨灿课题组 GitHub 组织（YangLabHKUST）。
- 杨王（Yang Wang）教授（博士联合导师）：港科大数学系资深教授，参与指导上述三篇代表作。
- 吴若昊（Angela Ruohao Wu，香港科技大学生命科学部/化学及生物工程学系）：与杨灿联合通讯指导 Portal 与 STitch3D，并共同参与小鼠狐猴细胞图谱（Nature 2025）工作，是连接计算方法与湿实验生物学端的关键合作者。
- 焦雨领（Yuling Jiao，武汉大学人工智能学院教授、博士生导师、副院长）：ICML 2021 薛定谔桥论文的共同作者（通讯作者之一）。焦雨领为武汉大学数学系博士（2014），入选国家高层次青年人才计划，是国内深度学习理论与生成式学习方向的知名学者，该合作将王戈飞接入武汉大学的机器学习理论学术圈。
- 北京师范大学数学科学学院：其本科母校，公开资料未披露持续合作关系。
4.3 国际合作
- 耶鲁大学赵宏宇（Hongyu Zhao）团队（博士后导师，当前最紧密合作圈）：赵宏宇为耶鲁大学生物统计系教授（zhaocenter.org），国际知名统计遗传学与生物信息学家。王戈飞在耶鲁期间几乎全部成果均以赵宏宇为通讯作者，包括 scMODAL（Nature Communications 2025，一作）、scLAMBDA（bioRxiv 2024，一作）、Nature Genetics 2026 空间转录组整合工作、多基因风险预测工作（AJHG 2025）等。该圈层内的重要合作者包括：
- 赵佳（Jia Zhao）：耶鲁生物统计系研究人员，与王戈飞共同一作/合作贯穿 STitch3D、Portal、scMODAL、Nature Genetics 2026 等多篇论文，是横跨其博士与博士后两个阶段最稳定的合作搭档；
- Yize Zhao（耶鲁大学生物统计系教授）：合作脑影像与脑连接组遗传学方向论文（Nature Communications 2026、Statistics in Medicine 2025）；
- Tianyu Liu、Yingxin Lin、Rui B. Chang 等（耶鲁团队成员）：分别合作空间组学整合、跨物种基因功能基础模型（NeurIPS 2025 Workshop）、单细胞多组学对齐等工作；Zhengwu Zhang（北卡罗来纳大学教堂山分校生物统计方向）亦参与脑影像合作论文。
- Tabula Microcebus 联盟（斯坦福—Chan Zuckerberg Biohub 国际细胞图谱合作网）：通过 Portal 等方法学工作，王戈飞作为联盟成员参与小鼠狐猴全生物体分子细胞图谱研究，两篇 Nature（2025）论文的合作者网络涵盖斯坦福大学 Stephen R. Quake、Mark A. Krasnow、Irving L. Weissman 等，Chan Zuckerberg Biohub 团队，康奈尔大学 Iwijn De Vlaminck，以及多伦多大学 Bo Wang 等国际计算生物学知名学者。这是其国际合作网络中"大科学计划"色彩最浓的一支。
- 国际期刊审稿网络：据其 CV，他受邀担任 Nature Biotechnology、Nature Communications、Genome Biology、Cell Genomics、Annals of Applied Statistics、PLOS Computational Biology 等 16 种国际期刊审稿人，显示其已在国际计算生物学共同体中承担学术服务功能。
五、业界合作关系深度分析
截至报告生成日，公开资料中未发现王戈飞与企业界的直接合作记录（无企业横向项目、联合实验室、专利、创业或产业任职的公开信息），其学术履历为纯学术机构路线（北师大—港科大—耶鲁—复旦）。本节基于其技术路线做结构性分析，供参考：
- 技术资产的产业转化潜力：王戈飞主导开发的 Portal、STitch3D、scMODAL、scLAMBDA 等工具均为开源软件（GitHub + ReadTheDocs 文档站），面向单细胞/空间组学数据分析这一当前生物医药 R&D 的热点基础设施领域。该类工具链与单细胞测序服务商、空间组学仪器厂商（如 10x Genomics、华大智造等所在赛道）、AI 制药企业的靶点发现与扰动响应预测需求天然契合，scLAMBDA（基因扰动响应预测）尤其与 AI 驱动的药物研发管线直接相关。
- 合作通道的现状：其现有产业连接主要为间接性的——一方面，Tabula Microcebus 联盟背后有 Chan Zuckerberg Initiative（陈—扎克伯格基金会/Biohub）这类非营利科研资助实体；另一方面，其合作者 Bo Wang（多伦多大学）等人身处学术—产业双栖生态。王戈飞本人回国后是否依托复旦大数据学院的平台（学院官网显示学院教师与华为、阿里、美团等企业有广泛合作传统）开展产学研合作，有待观察，公开资料未披露。
- 判断：与资深学者"成果—专利—企业项目—人才输送"的成熟产学研循环不同，王戈飞目前处于"方法学积累期"，其业界网络接近空白，属于典型的刚独立建组青年 PI 状态；其开源工具的实际采用情况（GitHub 社区、教程文档体系）是观察其未来产业影响力的先行指标。
六、重要奖项与学术兼职
| 类别 | 名称/内容 |
|---|---|
| 博士奖学金 | 香港博士研究生奖学金计划（Hong Kong PhD Fellowship, HKPFS），香港研究资助局/大学教育资助委员会（2019.09–2023.08） |
| 学术奖励（博士期间） | 港科大理学院 HKPFS 杰出学术与研究表现额外资助奖（2023.05）；港科大 RedBird 学术卓越奖（2022.05、2023.05 两度）；港科大数学系 Epsilon Fund Award（2022.05）；港科大优秀研究奖（2019.11） |
| 教学奖励 | 港科大数学系 Din-Yu Hsieh 教学奖（2022.05） |
| 会议奖励 | STATGEN 2025 Travel Award（2025.09） |
| 学术兼职（审稿） | Nature Biotechnology、Nature Communications、Genome Biology、Cell Genomics、Cell Reports Methods、Annals of Applied Statistics、PLOS Computational Biology、Human Genomics、Journal of Multivariate Analysis、Computer Methods and Programs in Biomedicine 等 16 种国际期刊审稿人（据其 CV） |
| 人才计划/学术组织领导职务 | 公开资料未披露 |
七、Connection 圈层总结
王戈飞的学术关系网络呈现"双师承锚点、跨太平洋中轴、大科学外围"的青年 PI 典型结构：
- 核心圈（师承层）：由两位博士导师杨灿（港科大数学系，生成式学习与统计组学方法）与杨王（港科大数学系资深教授），以及博士后导师赵宏宇（耶鲁生物统计系，统计遗传学）构成"数学方法—生物医学应用"的双锚点。值得注意的是，杨灿本人即曾任职于耶鲁，王戈飞的"港科大—耶鲁"路径是对导师学术轨迹的完整复刻，说明其师承网络内部存在强路径依赖与高信任度的安排。
- 同门与固定搭档圈：赵佳（耶鲁，跨博士与博士后两阶段的最稳定合作者）、吴若昊（港科大，湿实验端合作者）构成其方法学论文的固定班底；焦雨领（武汉大学）则是其在纯方法学（薛定谔桥/生成学习理论）方向的重要外部合作者，连接国内机器学习理论圈。
- 现单位圈（复旦大数据学院）：尚在建立中。方向上与周宝健（扩散模型/科学智能）、孙鑫伟（统计机器学习/医疗）、罗珞（优化理论/港科大数学系旧识）等年轻教师存在天然的协同空间，公开合作尚未披露。
- 大科学计划圈（国际外围）：通过 Tabula Microcebus 联盟接入斯坦福（Quake、Krasnow）—CZ Biohub—康奈尔—多伦多大学的国际细胞图谱网络，这是其网络中最具稀缺性的资源，为其后续参与人类细胞图谱级别的国际合作预留了通道。
- 产业圈：目前接近空白，其开源工具链（Portal/STitch3D/scMODAL/scLAMBDA）是最可能的产业化接口。
总体而言，王戈飞是国内"AI for Science（组学方向）"新生代中履历完整、产出高规格的代表人物之一：其网络资本集中于"港科大—耶鲁"这一横跨太平洋的高质量学术中轴，短板是本土学术根基（复旦圈、国内基金与产业网络）尚浅，未来 3–5 年其在复旦大数据学院能否将国际网络转化为本土的实验室建制与学生梯队，是观察其学术网络演化的关键。
主要资料来源
- 复旦大学大数据学院师资名录"副教授/副研究员"页（sds.fudan.edu.cn/17429/list.htm）——职称、博士院校、博士后经历与研究方向的官方确认；
- 王戈飞个人主页及 CV 页（gefeiwang.github.io，含 /resume/、/publications/、/teaching/）——教育履历、时间线、奖项、审稿兼职、论文与作者关系的本人一手来源；
- 香港科技大学数学系博士生研讨课公告（science.hkust.edu.hk，"SDE-based deep generative model"，讲者 Mr. Gefei WANG）——博士期间研究方向的第三方佐证；
- 杨灿教授学术讲座介绍（中山大学数学学院、华东师范大学，2025）——杨灿现职与 STitch3D 合作关系的佐证；
- 焦雨领教授公开资料（武汉大学教师主页 jszy.whu.edu.cn、公开百科条目）——其现职与学术头衔；
- OpenAlex API（作者消歧与同名档案合并问题排查；本报告未采信合并档案中的论文计量数据）。