SJTU-通用人工智能研究所 杨旸 教授
报告生成时间：2026年8月25日
个人主页：计算机学院教师页（Yang Lab）
所属团队：上海交通大学通用人工智能研究所
一、学者基本信息
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 姓名 | 杨旸（Yang Yang） |
| 职称 | 教授（2022 年至今）、博士生导师 |
| 所属单位 | 上海交通大学计算机学院（网络空间安全学院、密码学院）计算机科学与工程系 |
| 所在研究所 | 通用人工智能研究所（学院教师名录将其列为该所副所长） |
| 邮箱 | alayman@sjtu.edu.cn / yangyang@cs.sjtu.edu.cn |
| 办公地点 | 闵行校区电院 3-527 |
| 研究方向 | AI for Science：机器学习与大语言模型在生物、化学、材料科学与医学中的应用（智能分子设计、分子手性解析、生物医学图像处理） |
| 本科 | 上海交通大学计算机科学与技术 |
| 博士 | 上海交通大学计算机系硕博连读（计算机软件与理论方向） |
| 授课 | 人工智能 CS3317、面向科学领域的智能算法 CS7357、机器学习 CS7336/CS385 |
消歧说明：本报告传主为上海交通大学计算机学院教授杨旸，研究方向为 AI for Science / 计算生物医学，与上海科技大学杨旸教授（IEEE Fellow，无线通信、物联网、未来网络方向）并非同一人，亦无公开资料显示其从事分布式 AI 或智能电网研究；其身份、单位与方向均以上交计算机学院官方页面为准。国内另有若干同名"杨旸"学者（通信、自动化等方向），检索时极易混淆，需以邮箱 alayman@sjtu.edu.cn 与主页 compbio.sjtu.edu.cn 为准。
二、教育背景与职业履历
杨旸本科毕业于上海交通大学计算机科学与技术专业，随后在交大计算机系硕博连读，期间入选上海交通大学—美国加州大学联合培养项目，获计算机软件与理论方向博士学位（教师页）。其博士导师的具体身份在公开资料中未披露；从其 2016—2019 年的论文署名看，博士及留校初期与沈红斌（时任交大模式识别与生物信息学团队教授）、孔薇（W. Kong）等人长期合作，可推断其学术训练深受交大模式识别与生物信息学学派影响。其个人实验室主页亦将模式识别与生物信息学研究组列为关联链接。
履历方面，她曾赴美国加州大学河滨分校（UC Riverside）计算机科学与工程系担任访问学者，随后加入上海交通大学任教，在计算机系先后担任讲师与副教授（2017 年晋升），2022 年起任计算机学院教授至今。她现任通用人工智能研究所"人工智能交叉应用"方向中"AI 赋能生化医药前沿交叉研究"团队负责人之一（与涂仕奎、苏锐丹并列，见研究所介绍），并曾在计算机学院与瑞金医院党支部联组学习会上介绍通用人工智能研究所的整体研究情况，显示其在所内承担一定的管理性角色。
三、学生培养情况
杨旸为博导，其实验室（Yang Lab）公开了在读研究生名单，以下为直接指导关系有明确公开依据者。
1. 石润晗（在读博士生）
实验室主页列为博士生（方向 AI for chemistry）。其为 ICLR 2026《Learning Molecular Chirality via Chiral Determinant Kernels》、NeurIPS 2025《Reaction Prediction via Interaction Modeling of Symmetric Difference Shingle Sets》及《Cell Reports Physical Science》立体异构体几何表示框架论文的第一作者，是实验室"分子手性/化学反应预测"主线的主力学生；2025 年与陈乐天、（已毕业成员）等组队获第三届世界科学智能大赛材料设计赛道二等奖。
2. 余谷风（在读博士生）
实验室主页列为博士生（方向 AI for biology and chemistry）。其为《Journal of Cheminformatics》手性配体-催化剂开放数据库 Clc-db、TCBB 2026 阿尔茨海默病高阶遗传交互网络 GENIE 论文的第一作者，亦为 EPIC（Bioinformatics 2026）共同作者。
3. 陈乐天（在读博士生）
实验室主页列为博士生（方向 AI for chemistry）。其为 AAAI 2026《RTMol: Rethinking Molecule-text Alignment in a Round-trip View》第一作者，并参与 EpiCoCo（ICML 2026）等分子生成工作。
4. 陆文婧（在读博士生）
实验室主页列为博士生（方向 Biomedical Image Processing）。其为 IEEE TMI 2026 半监督医学图像分割论文第一作者，其不确定性校准工作入选 ICML 2026。
5. 李轶翀、潘洋、周启辉（在读博士生）
三人分别为生物信息学与生物医学图像处理方向博士生，李轶翀为 RNA 设计强化学习方法 DRAG（Briefings in Bioinformatics 2025）第一作者；潘洋、周启辉为 DRAG 论文合作者（潘洋亦为共同通讯署名者之一）。
6. 硕士生群体与已毕业学生
在读硕士生包括程宇佳（lncRNA 亚细胞定位）、徐薪、黄悦珊（EPIC 论文第一作者）、丁田、郭珺琨、肖真然（EpiCoCo 合作者）、张志成、卫雨禾等。据实验室新闻，黄悦珊与徐薪已于 2026 年 1 月通过硕士学位论文答辩。历史论文署名显示已毕业成员包括 W. Long（ImPLoc、FlyIT、HAMIL）、Y. Tu（SIFLoc、HAMIL、人脸聚类）、Y. Jin、J. Lu、R. Gao、L. Yuan、K. Zhang、X. Fu、Z. Ji 等，其毕业去向公开资料未披露。
四、学术合作网络
4.1 研究所内部
在通用人工智能研究所内，杨旸与所长赵海、脑机接口方向吕宝粮教授合作发表化学工程基础大模型 BatGPT-Chem（Research 2025，赵海与杨旸为共同通讯），是所内"大模型 + AI4Science"路线的代表性交叉成果；她亦与涂仕奎、苏锐丹共同承担研究所"AI 赋能生化医药"方向建设。其团队主页同时链接脑机科学与机器智能研究中心（BCMI）与模式识别与生物信息学研究组，历史上与 BCMI 体系联系密切。
4.2 跨机构（校内为主）
与自动化系（现自动化与感知学院）特聘教授沈红斌保持长期、高密度合作，2016—2024 年间在 Bioinformatics、Briefings in Bioinformatics、PLoS Computational Biology、ACS 相关期刊等发表大量蛋白质亚细胞定位、冷冻电镜图像分析、环状 RNA 结合位点论文，并作为第三完成人参与"生物医学大数据人工智能基础分析算法与在线预测应用系统"获 2018 年世界人工智能创新大赛（AIWIN）最高荣誉 SAIL 奖提名。此外，其从博士时期至今与原上海海事大学孔薇团队保持合作（microRNA 相关工作）。校内合作者还包括医学院附属医院系统的临床数据团队（如胃癌多模态诊断论文中的多单位署名）。
4.3 国际合作
国际方面，其最稳定的合作链路是阿尔茨海默病代谢组学与微生物组方向：与 Erasmus MC / 牛津大学的 Cornelia van Duijn、Najaf Amin 及杜克大学 Rima Kaddurah-Daouk 团队合作，在 JAMA Psychiatry（2023）、Translational Psychiatry（2025）等发表大样本人群多组学论文，杨旸为署名合作者；GENIE（TCBB 2026）亦由该合作网络产出。她曾赴荷兰奈梅亨参加 Computational Structural Immunology Symposium 2025 并作特邀报告（表位设计扩散模型方向），显示其正拓展计算免疫学国际合作。加州系统（UCR 访问学者、博士期间联合培养）为其早期国际经历，但具体合作者公开资料未披露。
五、业界合作关系深度分析
公开渠道未见杨旸以首席科学家或联合实验室负责人身份深度绑定某家企业的记录，其业界合作呈现"项目制 + 教学共建"特点：
- 华为：2020—2025 年连续获"华为云与计算先锋教师"称号（教师页获奖信息），并有教育部—华为产学合作协同育人背景的教学合作痕迹，但未见联合研发项目披露。
- 国家重大任务：主持科技部重点研发计划课题"深海动物原位快捷智能感知技术"（2023YFC2811502，2024—2026），该课题面向海洋工程场景的智能感知，属 AI 技术向重大工程应用的转化通道，具体产业合作单位公开资料未披露。
- 行业竞赛与转化：指导学生获 iGEM 金奖与最佳软件项目提名（2021）、CCF CBC2023 数据挑战赛一等奖、世界科学智能大赛材料设计赛道二等奖（2025），通过竞赛与开源工具（Clc-db 数据库等）实现 AI4Science 成果的外溢。
- 横向应用：其航空铝合金知识驱动材料设计系列论文（与上海大学团队）与 BatGPT-Chem 化工大模型表明其成果面向材料、化工产业需求，但企业委托方与合作模式未见公开披露。
六、重要奖项与学术兼职（表格）
| 年份 | 奖项/兼职 | 说明 |
|---|---|---|
| 2025 | 世界科学智能大赛材料设计赛道二等奖 | 指导教师 |
| 2025 | 上海交通大学三八红旗手 | 个人荣誉 |
| 2025 | 上海交大教学成果奖二等奖 | "科学智能驱动的复合型研究生培养模式创新与实践"，排名第一 |
| 2024 | 上海高校市级重点课程"人工智能(B类)"负责人 | 课程建设 |
| 2023 | 上海交大教书育人奖一等奖 | 计算机基础课程教学团队成员 |
| 2021 | iGEM 国际基因工程机器大赛金奖、最佳软件项目提名 | 指导教师 |
| 2020—2025 | 华为云与计算先锋教师 | 教学类 |
| 2018 | 世界人工智能创新大赛 AIWIN 最高荣誉 SAIL奖提名 | "生物医学大数据人工智能基础分析算法与在线预测应用系统"，排名第三 |
| — | 期刊编委 | Neural Networks、Frontiers in Genetics |
| — | 学会任职 | CCF 生物信息专委会委员、中国人工智能学会生物信息与人工生命专委会常务委员 |
| — | 会议组织 | 生物信息学与智能信息处理 2017 学术年会组织主席 |
七、Connection圈层总结
杨旸是通用人工智能研究所"AI for Science"路线的核心骨干与所领导层成员，其学术网络呈现三条主线：其一，交大生物信息学派线——以沈红斌为代表的模式识别与生物信息学团队构成其最长期的科研共同体，涵盖蛋白质/RNA 分析与医学图像两个方向；其二，AGI 研究所大模型线——与赵海、吕宝粮通过 BatGPT-Chem 等项目实现"脑启发大模型 × 化学"的所内协同，与涂仕奎、苏锐丹共建 AI4Bio/Chem 方向；其三，国际医学组学线——van Duijn/Amin（阿尔茨海默病代谢组学）为其主要国际合作伙伴。学生梯队（石润晗、余谷风、陈乐天、陆文婧等）已在 ICML/ICLR/NeurIPS/AAAI 与 Cell 子刊形成稳定的分子设计与医学影像成果输出。对求职者/合作者而言，她的团队是交大计算机学院内"机器学习 + 化学/生物/医学"交叉方向的代表性入口，产业端则以华为教学合作与国家重点研发课题为主要触点。